优势:
鉴定准确性高:质谱可以高灵敏度、高分辨率检测样品，保证检测结果的准确性 。
应用广泛:质谱不仅可用于单一蛋白质分析，还可用于高通量蛋白质分析，可同时检测多种蛋白质，大大提高了效率 。
蛋白质的修饰可以被识别:质谱可以检测蛋白质的各种修饰，如磷酸化、甲基化、抑制乙酰化等 。这些修饰对蛋白质的功能有很大的影响 。
缺点:
复杂度高:质谱涉及一系列操作程序，包括样品预处理、分离纯化等 。操作过程极其复杂，技术支持要求高，准备时间长 。
成本高:质谱设备价格昂贵，维护也需要大量资金投入，所以小桥的资金支持非常高 。
复杂的数据处理:质谱数据通常是大规模复杂的数据，需要专门的软件进行分析，操作难度较大 。
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