图像分割评价指标:Dice和MIoU

【图像分割评价指标:Dice和MIoU】目录MIou 代码Dice和MIoU两者的关系参考链接
Dice 理论
Dice用来衡量预测结果pred和标签label的相似度,公式如下图所示,即两个集合的交集/并集 。
注意:对于多分类的分割任务,网络的输出结果是多通道的,使用Dice计算准确度需要将标签转换为多通道的形式 。
代码
def dice_acc(predict, label):"""计算多个batch的dicc@param predict: 模型预测值,Shape:[B, C, W, H]@param label: one_hot形式的标签 , Shape:[B, C, W, H]"""batch_num, class_num = predict.shape[0: 2]assert predict.size() == label.size(), "the size of predict and target must be equal."# 计算交集intersection = (predict * label).reshape((batch_num, class_num, -1)).sum(dim=2)# 计算并集union = (predict + label).reshape((batch_num, class_num, -1)).sum(dim=2)dice = (2. * intersection + 1) / (union + 1)dice = dice.mean()# loss = 1 - dicereturn dice
MIou 理论
为了计算MIoU,我们需要先引入混淆矩阵的概念 。所谓混淆矩阵,就是真实结果和预测结果所组成的矩阵,将整个结果集划分为TP,TN,FP,FN四类 。
有了混淆矩阵后,我们可以在此基础上计算各种评价指标:
查准率
查全率
MIoU 平均交并比
上面的公式对应到混淆矩阵A上为 A(i, i) / A(i, : ) + A(:, j) - A(i, j),即对角线元素比上(对角线元素所在行和列的元素和 - 对角线元素) 。
注意:为了计算MIoU , 我们需要把多通道的预测结果通过torch.()函数转化为单通道的预测类别,然后和单通道的label计算交并比 。
代码
为了计算MIoU , 这里提供两种方式,一种是比较高效的矩阵运算,另一种是常规的好理解的但效率不高的方式,两者都可以用 。
高效的矩阵运算
def miou(predict, label, class_num=3):"""计算多个batch的moiu@param predict: 模型预测值,Shape:[B, W, H]@param label: 标签 , Shape:[B, W, H]"""batch = label.shape[0]predict, label = predict.flatten(), label.flatten()# 忽略背景的话就 >0k = (predict >= 0) & (predict < class_num)# 计算混淆矩阵hist = torch.bincount(class_num * predict[k].type(torch.int32) + label[k], minlength=batch * (class_num ** 2)).reshape(batch, class_num, class_num)# 将多个batch合并为一个,如果传入的参数没有batch这个维度,可以注释掉这句话hist = hist.sum(0)# 计算各个类的ioumiou = torch.diag(hist) / torch.maximum((hist.sum(1) + hist.sum(0) - torch.diag(hist)), torch.tensor(1))# 计算平均值mioureturn miou.mean()
低效的好理解的
def IOU(pred, target, n_classes = 3 ):"""计算miou@param predict: 模型预测值,Shape:[W, H]@param label: 标签,Shape:[W, H]"""ious = []# 从1开始,即忽略背景# 依次计算每个类for cls in range(1, n_classes):pred_inds = pred == clstarget_inds = target == cls# 计算两个集合在该类上的交集intersection = (pred_inds[target_inds]).sum()# 计算并集union = pred_inds.sum() + target_inds.sum() - intersectionif union == 0:ious.append(float('nan')) # If there is no ground truth,do not include in evaluationelse:ious.append(float(intersection.item()) / float(max(union.item(), 1)))# 计算多类的平均值 return torch.mean(torch.tensor(ious))
注意,这种的传入的参数是二维的,不能有batch维度 。
计算混淆矩阵
这里提供一个计算混淆矩阵的快速实现,但很低效,仅供看看,实际还是要用上面torch.计算混淆矩阵快 。
# TP predict 和 label 同时为1TP = ((pred1 == 1) & (label == 1)).cpu().sum()# TNpredict 和 label 同时为0TN = ((pred1 == 0) & (label == 0)).cpu().sum()# FNpredict 0 label 1FN = ((pred1 == 0) & (label == 1)).cpu().sum()# FPpredict 1 label 0FP = ((pred1 == 1) & (label == 0)).cpu().sum()
Dice和MIoU两者的关系
对于二分类的任务来说,二者思想都是交集/并集,但dice并不是在分母上减去交集,而是将交集在分子上算了两次 。
对于多分类来说,Dice是将预测结果转为了多通道,而MIoU只在一个通道上计算 。
参考链接