汉坦病毒( 二 )

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汉坦病毒基因分析各国学者採用病毒与宿主的基因分析方法，研究汉坦病毒分离株之间或宿主动物之间亲缘关係的远近，以及病毒与宿主动物的共演化。汉坦病毒基因分析J.W.Song等从韩国绒鼠(Eothenomys regulus)分离了两株PUU相关病毒，命名为Muju(MUJ)病毒。两株病毒G2基因241bp片段序列存在1.2%差异，G2基因241bp片段和S基因208bp片段与PUU病毒相应片段序列的同源性分别为79.5%～83.4%和80.3%～81.2% 。L.Yashina等从俄罗斯远东鼠(Clethrionomys)、姬鼠(Apodemus)和HFRS病人分离的HTN病毒，M片段序列同源性86%～89%，从轻型HFRS病人分离的SEO病毒，M片段序列同源性97% 。M.Drebot首次报告了加拿大草原田鼠携带PH样病毒。加拿大不同省份SN病毒M、S片段序列存在25%的差异，并且加拿大西部SN病毒株与加拿大东部SN病毒株相比，毒株间基因序列更为接近。Yong-Kyu Chu等报告来源于印尼板齿鼠的病毒株可被SEO型特异引物扩增，M片段290bp序列分析表明与SEO病毒有7%的差异；来源于泰国板齿鼠的病毒株中，2株为SEO病毒，另1株可被HTN型特异引物扩增，M片段290bp序列分析表明与THAI 749毒株有1%的差异。J.W.Song等将来自波兰的TUL病毒与俄罗斯中部和捷克斯洛伐克共和国的TUL病毒比较，核蛋白与G2糖蛋白胺基酸序列同源性大于96%，系统发生分析表明波兰的TUL病毒与俄罗斯中部TUL病毒最为接近，但也存在差异。C.Sibold等的另一项研究——对核蛋白编码基因进行系统发生分析表明，西斯洛伐克TUL病毒与捷克TUL病毒相近，东斯洛伐克TUL病毒与俄罗斯中部TUL病毒相近；而3’-NCR的系统发生分析表明，东斯洛伐克TUL病毒与西斯洛伐克和捷克的TUL病毒相近。作者认为，存在东斯洛伐克TUL病毒从中欧和俄罗斯TUL病毒重组的可能性。

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汉坦病毒宿主动物基因分析多採用细胞色素B基因分析方法。W.C.Black IV等採用微卫星DNA分析确定鹿鼠之间的基因关係，并研究了鼠类窝内汉坦病毒传播的方式。病毒与宿主动物的共演化俄罗斯远东地区南部的7种宿主动物中存在4种汉坦病毒(HTN、PUU、SEO、KBR) 。L.Minskaya等的研究表明，从非主要宿主动物分离的病毒与标準株抗原性接近，但在基因分子特徵上与从主要宿主动物分离的病毒不同。A.Vaheri等的研究表明，西伯利亚旅鼠分离的TOP病毒与东方田鼠分离的KBR病毒S片段同源性核苷酸水平为82%，胺基酸水平为96%；与欧洲棕背分离的PUU病毒S片段同源性核苷酸水平为77%，胺基酸水平为87% 。系统发生分析显示3种病毒具有共同的起源，与相应宿主动物细胞色素B基因系统发生分析结果相一致，表明3种病毒进化过程中有在宿主动物之间进行的水平传播。其中TOP病毒M、S片段3’-NCR最长，可能在3种汉坦病毒中起源最早。J.W.Song等报告韩国姬鼠来源的不同HTN病毒株，M基因324bp片段同源性95%～99%，姬鼠细胞色素B基因424bp和线粒体DNA D-环区序列差异性0%～3.1%，表明韩国不同地区姬鼠有相同的基因背景，HTN病毒具有相同的来源，在韩国没有发现HTN病毒株与其宿主动物共同发生较大变异的现象。Heiske A.等进行的系统发生分析表明，欧洲西部PUU病毒与瑞典、芬兰、俄罗斯的PUU病毒不同，同一分枝PUU病毒S片段开放读码框架基因差异性小于8%，不同分枝PUU病毒S片段开放读码框架基因差异大于14% 。同一分枝PUU病毒核蛋白胺基酸序列差异0%～2%，不同分枝PUU病毒核蛋白胺基酸序列差异3%～5% 。有资料表明，不同地区的欧洲棕背可以分为几个亚类，这一研究支持了PUU病毒与其宿主动物共演化的观点。L.Ivanov等对来源于俄罗斯远东地区东方田鼠的KBR病毒进行研究，结果表明不同KRB病毒株间存在0.5%～4.0%的基因差异，基因差异与捕鼠地区的关係大于与捕鼠年份的关係，表明KBR病毒与东方田鼠之间存在长期的共演化过程。