最快基因诊断吉尼斯世界纪录——26小时!速度背后的真相是什么? 吉尼斯记录查询序列号( 二 )


WGS-26的另一个局限性在于它的研究方法及致病基因型的验证检测 , 这种检测往往需要诊断报告 , 且至少需要两天时间 。当检测协议与CLIA和CAP关于LDTs(实验室开发的测试)的指南相符时 , 验证测试的要求将由公认的实验室主管通过一次次案例最终确定 。然而 , 在未来几年 , 高质量的复杂LDTs(如医疗中全基因组测序)需获取FDA的批准 。
全基因组测序的第三个局限性是缺乏全面的阴性预测值 。除了不完美的灵敏度分析 , 诊断的敏感性受限于对致病性变异知识的缺乏 。尤其是致病性内含子及调控变异在临床数据库中的比例不足 , 且与意义不明的外显子变体相比 , 不能通过已有的致病性预测工具对其粗略分析 。
WGS-26在医疗中未解决的问题是样本的多路复用及价格 。WGS-26测试一个样本(双测量管)的试剂成本为6500美元 , 是HiseqX WGS成本的八倍 。计算机及自动化分析的价格差异很大 , 平均每个基因组大约100美元 , 解释和报告的价格大约在70-700美元 , 这根据变体而异 。因此 , 成本是WGS-26被广泛采纳的一个重大障碍 。
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下一个吉尼斯世界纪录——WGS-24将在2020年实现?
2001年 , 6个国家的科学家花了11年的时间 , 花费30亿美金 , 共同发表首个人类基因组工作草图 。随着技术的进步 , 我们实现了1000美元成本的基因测序 , 且检测时间也大大缩短 。近年来 , 测序应用依托于英特尔技术和阿里云在线服务的模式不断呈现出来 , 英特尔公司高级副总裁、数据中心及互联系统事业部总经理柏安娜曾表示 , 在这种模式下 , 完成包括基因序列检测、数据分析、疾病诊断 , 以及制定个性化治疗方案在内的精准医疗的主要过程也许用不了24小时 , 并希望在2020年 , 能在24小时内完成对一个人的全部基因组测序 。
倘若WGS-24真的实现了 , 那么它是否能解决WGS-26目前存在的局限性?它是否能克服在遗传性疾病中面临的障碍?这些问题也许并不能轻易作答 。
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