日本无条件投降一周后，日本航母潜艇收到最后命令：毁掉潜艇编队的所有武器和重要文件 。于是，“伊-401”号销毁了所有图表、代码组、日志以及重要文件，并射空全部鱼雷 。“伊-400”号也做了类似处理 。“伊-401”随后被美军带到夏威夷 。在那里，美国海军专家进行了检查，他们对日军技术的先进感到惊讶 。为防止苏联等共产主义国家获得这些机密，1946年5月，美军将这些航母潜艇毁掉，沉入海底 。
【震惊：二战日本打造航母潜艇欲对美国发起生化攻击】
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