成化十三年二月，汪直心腹锦衣卫百户韦瑛称杨荣之曾孙杨业家赀巨万，常杀人，将招纳亡命下海 。汪直发兵籍没福建都指挥杨业，词语牵连连兵部主事杨仕伟、中书舍人董璵，俱下狱濒死 。韦瑛并籍其家 。三月，左都御史李宾奏拟妄报妖言者连坐处斩，而当时西厂旗校即以捕妖言图官赏，从而大量百姓被捕冤死 。同年四月，汪直令韦瑛逮捕通政使司左通政方贤、太医院判蒋宗武下西厂狱;当时礼部郎中乐章、行人张廷网出使安南归还，刑部郎中武清从广西勘事归还，浙江布政使刘福起复至京师，均被汪直并令韦瑛逮捕 。御史黄本在云南、贵州清军刷归还，汪直令韦瑛搜得一个象笏，被逮捕送锦衣卫，被被贬为民 。
同年五月，因为当时汪直开西厂，罗织数起大狱，百姓害怕，大学士商辂上疏称请革去西厂，罢汪直并诛韦瑛;并与宪宗发生争执，宪宗最後批准此疏，罢免西厂 。并谪韦瑛戍宣府 。西厂的废除并没有直接导致汪直势力的衰弱，很快汪直恢复御马监职位 。同年六月，御史戴缙、王亿等人因多年无法升迁，於是依附汪直，进言称汪直为官“直釐奸剔弊，允合公论”、“汪直所行，不独可为今日法，且可为万世法”，并请求恢复西厂 。宪宗大喜，并恢复西厂 。
此事前後，左都御史王越因西征而与韦瑛相识，此後交往甚深，之後依附汪直 。王越屡次想取代项忠的兵部尚书之职 。恰逢当时项忠率领九卿弹劾汪直，两人在朝堂上亦辞色甚厉 。此後汪直命东厂官校，发江西都指挥刘江、指挥黄宾等事诬陷诋毁项忠 。此时给事中郭镗、御史冯瓘因依附汪直而交相弹劾项忠 。项忠在朝廷上慷慨激辩而仍然下狱，竟连坐削籍 。兵部武选郎中、姚璧(尚书姚夔之子)亦因联系九卿而弹劾汪直，亦被降职调 。不久，大学士商辂、尚书薛远、董方，左都御史李宾一同致仕;而依附汪直的王越担任兵部尚书兼左都御史掌都督院事 。十一月，汪直党羽御史冯瓘为大理寺丞，戴缙为尚宝司少卿，后擢升佥都御史;王亿为湖广按察副使 。成化十四年五月，汪直请奏请武举设科，乡、会、殿试如进士例 。
成化十四年(1478年)，海西兀者都指挥散出哈上书，言开原验放管指挥索其珍珠豹皮 。宪宗命辽东守臣勘查，管指挥者惧 。恰逢当时散出哈侄产察入贡而指挥贿赂的事情，后经调查证明是诬陷 。此後又散出产察发怒，谋聚众入犯边界 。守臣於是翻译番书，招散出哈来广宁当面对峙，此後发生争执，散出哈纠结部队入边，战事一触即发 。汪直听闻心腹王英之言，以为镇抚辽东可以立功，於是请求前往 。宪宗欲批准，而司礼监怀恩认为汪直年少喜功，於是去南阁，召集兵部尚书余子俊、兵部侍郎马文升商议 。随後举荐马文升、詹升前往 。汪直欲令王英与其一同前往，马文升婉言拒绝了，因此招致汪直愤恨 。
马文升赴任巡抚后，命贡使重阳归谕其众，告诉明朝廷旨意 。然而当时海西纵容部队进犯，马文升於是击败后再加以安抚 。事情传到朝廷中，汪直称：“既然说安抚怎麼又来进犯边界?”於是向朝廷请求亲自前往 。辽东各部听闻汪直擅政，不肯去接受器安抚 。汪直行至开源，马文升在抚顺，汪直亦不与其联系会合 。於是马文升招抚的兀者、野人、堵里吉三百馀人皆怒欲归 。参将周俊恐怕此事白，於是对汪直称必须请马文升见面 。此後马文升抵达后，汪直问解决方略，马文升称：“太监既至，此属即太监招出者也，何间彼此 。”汪直知道此事不易解决，於是听闻马文升建议，一同抵达辽阳，再将事情汇报宪宗 。
【汪直擅政的经过：西厂开始残害忠良宦官结党营私】