没有化石也没关系。尼安德特人的DNA也可以从土壤中获得!

今天给大家介绍一下土壤的样本以及土壤调查的相应知识点 。希望对你有帮助,也别忘了收藏这个站点 。
没有化石也没关系 。尼安德特人的DNA也可以从土壤中获得!
在过去的十年中,从人类遗骸中获取古代DNA的研究已经成为一项突出的研究,它使我们对人类和其他生物的进化史有了更深入的了解 。除了人类遗骸,少数研究还从其他材料中获得了DNA,如牙结石、钙化结核和死海古卷(也就是死海古卷!),刮破古籍书页的橡皮擦屑,甚至口香糖,都有成功的案例 。[1, 2, 3, 4, 5]
土壤里有古生物DNA吗?!土壤里有DNA吗?
最新发表的论文是从遗址的土壤中分离出DNA,拼凑出尼安德特人的基因组 。除了感叹高超的新技术和充满希望的未来,这项研究还为尼安德特人的伟大历史带来了新的视角 。[6, 7, 8]
从场地土壤中获取目标DNA
遗址里一定没有化石或者石器,但是一定有很多土壤 。生物死亡后,DNA分解,散落在周围的土壤中 。如果遗址地层中有化石,按理说DNA也有机会存活 。
问题是土壤中可能会留下各种生物的DNA片段,非常难以分辨 。土壤采样往往不是不可以,只是动物、植物、微生物中杂乱的DNA太多了 。
【没有化石也没关系。尼安德特人的DNA也可以从土壤中获得!】在如此杂乱的样本中,你仍然可以只分离出你想要的特定DNA,但你必须先设定要抓谁,并设计出与目标序列互补的探针 。
在西班牙 de las 的废墟中 。挖!参考文献7
2017年发表的论文成功捕获了包括尼安德特人在内的多种动物的线粒体DNA,证实了从土壤中获取特定的DNA片段是可行的 。2020年,论文获得了青藏高原夏河和白石崖洞穴不同地层丹尼索瓦人的线粒体DNA 。[9, 10]
但是,线粒体和细胞核是两个独立的遗传单位,它们携带的信息有很大的不同 。在人类中,线粒体中大约有16,500个碱基对,细胞核中有30亿条染色体 。可想而知,即使能捕获线粒体的所有DNA,与核基因组相比也是微乎其微,捕获30亿个碱基对的难度完全是不同的维度 。
幸运的是,尼安德特人和智人的基因差异是相似的 。为方便起见,不需要捕获整个基因组,只需选择尼安德特人特有的DNA变异,针对那些部分 。
基于这一想法,研究人员设计了探针来定位尼安德特人基因组上160万个可能的突变位置 。如果土壤样本中的DNA片段匹配,它们将被捕获用于进一步分析 。
遗址和样本的地理位置:和洞穴位于中亚,位于高加索,其余遗址位于欧洲 。参考文献6
深入讨论的三个遗址,中亚的丹尼索瓦洞穴和西方的夏加尔的斯卡亚洞穴,都获得了高质量的尼安德特人基因组,适合比较 。从两个地点获得的“妮妮”DNA的遗传变异与当地已知物种最接近,不出意外,也证明了新的采样分析方法是可行的 。
西班牙的尼安德特人属于不同的基因群 。
另一处遗址Galería de las (),位于西班牙东北部,可分为多个地层,距今7万年至11万年;出土了大约500件石器,都属于Most风格 。这个地方本该是尼安德特人的家园,但只留下了一块脚趾骨折的化石 。
西班牙 de las 遗址的地层和内容 。参考文献6
根据新的泥浆技术,从这里的四个地层中成功分离出了尼安德特人的DNA,证实了他们在这里生活了很长时间 。有趣的是:
早期和晚期尼安德特人属于不同的基因组 。
如果按时间顺序只有两个样本,那一看肯定是连续关系 。然而,到目前为止,古代DNA研究已经积累了18个尼安德特人(来自14个地点)、4个丹尼索瓦人和1个巴尼班丹人(都来自丹尼索瓦的一个洞穴)的基因组,以便我们可以更详细地比较他们的亲属 。