在生物分类上 ， 单孔类从属于原兽类 。现生有袋类和它们的化石祖先从属于后兽下纲 ， 胎盘类和它们的化石祖先从属于真兽下纲 。单孔类哺乳动物的数目十分稀少 ， 只有3种 。目前现存的哺乳动物中 ， 99%是有胎盘动物或者有袋类 ， 有胎盘类数目多达5500多种、而有袋类仅有270种 。有袋类动物和有胎盘动物构成了现存所有哺乳动物总数的99.9% ， 因而有关有胎盘类和有袋类的分异时间是哺乳动物进化研究中关键性的科学问题 ， 极大地影响了现代地球生态系统的格局 。
另外混元兽的外鼓骨形状像是C ， 与现生负鼠类相似 ， 与单孔类 ， 辽尖齿兽构成一个生物演化序列 。这个演化序列重演了现生有袋类胚胎外鼓骨的每个发育阶段 。
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