（以上剧情来自于《仙剑奇侠传三外传·问情篇》）蛤蟆谷收妖在《仙剑奇侠传》故事发生年代的一日，独孤剑圣夜观星相，预见到蛤蟆谷会发生极大的血光之灾，于是在蛤蟆谷巡逻 。在山上，独孤剑圣看到赶路的一对男女（李逍遥和林月如），劝二人速速下山 。然而李逍遥坚持要赶路，独孤剑圣便不再劝告，希望他们好好考虑，随后便御剑离开 。
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《新仙剑奇侠传》的剑圣在一间野店外，独孤剑圣看到满地尸首，也察觉到轿子里的姑娘（赵灵儿）是妖身，于是认定她是杀人兇手，也不听她解释，便抓走了赵灵儿，并投入锁妖塔 。师弟回山独孤剑圣看到李逍遥后，酒剑仙在一边问独孤剑圣他选人的眼光是否不错，但独孤剑圣没有正面回答，只是说酒剑仙难得收心不再乱跑了 。酒剑仙顺着剑圣的话说自己老了，自然是跑不动了，引得剑圣也感慨年华已老，想找个合适的接班人来继承蜀山仙剑派的绝学，同时无奈地指出酒剑仙乱来，把蜀山派的剑术传给外人 。酒剑仙自信看人很準，对李逍遥十分放心，而且李逍遥的天份是极高的；独孤剑圣附议 。酒剑仙看师兄没有反对的意思，让李逍遥做蜀山仙剑派弟子，然而李逍遥以自己还是俗世之人为由拒绝酒剑仙的好意 。独孤剑圣让李逍遥再考虑，因为除了掌门人，其余弟子并非一定要出家，只要遵守蜀山派的戒律即可 。李逍遥表示可以考虑，随后询问独孤剑圣是否救过年轻的女孩子，剑圣否认了 。当李逍遥在门派中发现了玉佛珠，知道赵灵儿被投入了锁妖塔 。李逍遥很快去找剑圣，要剑圣放了赵灵儿 。而剑圣以赵灵儿是妖为由，坚决不放 。李逍遥决定要自己闯锁妖塔去救人，剑圣提醒他自创派百年来没有人能活着从锁妖塔出来 。不久，剑圣得知酒剑仙帮助李逍遥和林月如闯入锁妖塔，责怪他为什幺不阻止他们 。锁妖塔被破坏后，剑圣和酒剑仙将受了伤的李逍遥、赵灵儿和林月如送到圣姑处疗伤，并让圣姑不要告诉他们说他来过 。（以上剧情来自于《仙剑奇侠传》）因李逍遥资质超群，独孤剑圣将蜀山仙剑派掌门传给了李逍遥 。（以上剧情来自于《仙剑奇侠传二》）影视版本在根据单机游戏《仙剑奇侠传》改编同名电视剧《仙剑奇侠传》中，独孤剑圣名为殷若拙，由郭亮出演 。在仙剧中独孤剑圣被塑造成为了一个颇有争议的人物 。剑圣年轻时，下山体验人生，师弟酒剑仙把一块恋人吊坠交给了他，导致剑圣遇到了拥有另一半吊坠的女孩林青儿，两人相恋，体验了人间的苦与乐 。剑圣因为道，没有跟林青儿成亲，最终因爱得道 。