荷兰海、陆作战均告失败，赤嵌城和台湾城已成为两座孤立的城堡，相互间的联系完全割断 。荷方承认，当时赤嵌城守军“力量单薄，处境危急”，“热兰遮城堡也由于地势关系，难以坚守，热兰遮市区更是完全处于敌军的包围和控制之下” 。
郑成功随即加紧对赤嵌城的包围 。该城周围45丈，高3丈6尺，城墙上有4座炮楼 。四月三日，郑军的士兵在赤嵌城外抓到了描难实叮的弟弟和弟媳 。郑成功对他们讲明利害，令其回城，劝说描难实叮投降 。接着，又派部将杨朝栋和翻译吴迈、李仲前往劝降，表示绝对不会加害他们，并允许荷兰人带走自己的财产 。四月四日，赤嵌城的水源被台湾人民切断 。描难实叮见援兵无望，孤城难守，不得不挂白旗投降 。这样，郑成功在登陆后第四天，就收复了赤嵌城 。
描难实叮投降后，奉郑成功之命前往台湾城劝揆一无条件投降，遭到揆一拒绝 。郑成功与诸将分析形势，认为不给侵略者以迎头痛击，敌人是不肯投降的，于是命令军队从鲲(鱼+身)南端登陆，“移扎鲲(鱼+身)山即一鲲(鱼+身)，候令进攻台湾城” 。
【郑成功收复台湾经过：郑成功是如何收复台湾的？】

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