牛枝子的根为轴根系，播种后当年根长可达50厘米以上，垂直下伸，第二年主根入土深度可达100厘米，粗细均匀，呈圆锥状 。因其根系在土层中可形成垂直和水平的网络，故可充分利用土层中的水分和养分，在固定沙地上播种牛枝子，有明显的固沙和防止土壤侵蚀的作用 。
除了主根，它的侧根和不定根，都长得非常粗壮、结实 。它的侧根与不定根一般呈放射状水平伸展，在干旱时则呈弧形向上层纵伸 。牛枝子的木质化根颈十分发达，常呈不规则状，能经受家畜的践踏和沙埋，就算受风蚀而裸露于地表，仍能正常地生长发育 。
此外，牛枝子开花时期有蜜有粉，也是一种辅助蜜源植物 。在半农半牧区，也可用做绿肥 。
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